AfterEffects警告：ファイル「—–」はロックされています。このファイルには変更を保存できませんのメッセージが出ます。

解凍ソフトが立ち上がっている状態のままなど、他のソフトウェアからもaepファイルへの参照がある場合などに発生します。

編集上の問題は発生せず、何事もなく編集が可能です。上書き保存でエラーメッセージが仮に出る場合であっても、「別名で保存」を選択すれば問題なく保存が可能です。

特に問題はありませんのでそのまま操作を続けてください。